La commune de Bonnefontaine est membre de 5 groupement(s)
| # | Nom groupement | Membres | Dpt |
|---|---|---|---|
| - | CC Bresse Haute Seille | 54 | 39 |
| - | SI de travaux des Longeailles | 7 | 39 |
| - | SIVOS du premier plateau | 8 | 39 |
| - | SI des eaux La Marre, Picarreau | 4 | 39 |
| - | SM d'énergies, d'équipements et de communication (SIDEC) du Jura | 511 | 39 |